Selon Liquid Snake, les gènes dominants de Big Boss aurait tous été donnés à Solid Snake et Liquid aurait hérité seulement des gènes récessifs, et c'est pourquoi il considère qu'il n'est qu'un déchet. Cependant, lors d'une conversation entre Revolver Ocelot et Solidus Snake, Ocelot affirme que c'est Snake qui aurait hérité des « mauvais » gènes. Et donc, que Liquid posséderait les gènes dominants. Cependant, aucun des deux n'apprend la vérité : ils sont tous les deux égaux au niveau des gènes. Les détails sur son passé ne sont pas nombreux. On sait seulement qu'il est né en 1972 , qu'il a été élevé par beaucoup de personnes et que celles-ci ont découverts qu'il avait un QI de 180 . En 1991, Snake infiltra l'Irak pendant la Guerre du Golfe avec un peloton de Bérets Verts. Il n'était à cette époque qu'un enfant selon ses propres dires.